Nel complesso la gestione della terapia antiretrovirale, grazie alla disponibilità di un maggior numero di farmaci antiretrovirali e di strumenti accurati per il monitoraggio, si va orientando verso un'impostazione sempre più personalizzata del trattamento. Ciò non significa però che non esistano dei principi generali ai quali ci si deve attenere. In tutto il mondo sviluppato, infatti, il trattamento delle persone con HIV si basa su Linee Guida preparate da esperti che, con alcune differenze locali, si ispirano a principi comuni, e affrontano le tematiche principali, quali: quando e come iniziare la terapia, quando e come cambiare combinazione farmacologica, cosa fare quando non ci sono opzioni terapeutiche residue. Ulteriori Linee Guida riguardano il problema della profilassi e del trattamento delle infezioni opportunistiche (argomenti che hanno subito modificazioni radicali dopo l'introduzione della terapia HAART), della terapia in età pediatrica e di quella in gravidanza.
Recentemente, inoltre, un gruppo di esperti convocati dall'Organizzazione Mondiale della Sanità in collaborazione con UNAIDS ha preparato un documento che, pur non essendo una vera e propria Linea Guida, definisce alcuni principi di Terapia Antiretrovirale per i paesi in via di sviluppo. ( Xagena_2001)